Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brf1Q8CFK2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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