Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph6aQ8CDR2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms