Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms