Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nhsl1Q8CAF4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.8 ms