Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rft1Q8C3B8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms