Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms