Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Triml1Q8BVP1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms