Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pbrm1Q8BSQ9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pbrm1Q8BSQ9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pbrm1Q8BSQ9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pbrm1Q8BSQ9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Pbrm1Q8BSQ9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms