Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMV6

E130116L18Rik, RIKEN cDNA E130116L18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130116L18RikQ8BMV6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms