Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prox2Q8BII1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prox2Q8BII1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prox2Q8BII1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prox2Q8BII1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prox2Q8BII1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prox2Q8BII1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prox2Q8BII1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prox2Q8BII1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prox2Q8BII1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prox2Q8BII1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prox2Q8BII1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prox2Q8BII1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prox2Q8BII1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prox2Q8BII1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prox2Q8BII1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prox2Q8BII1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prox2Q8BII1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prox2Q8BII1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prox2Q8BII1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prox2Q8BII1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prox2Q8BII1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prox2Q8BII1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms