Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH32

Susd4, Sushi domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd4Q8BH32 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Susd4Q8BH32 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Susd4Q8BH32 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Susd4Q8BH32 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Susd4Q8BH32 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Susd4Q8BH32 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Susd4Q8BH32 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Susd4Q8BH32 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Susd4Q8BH32 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Susd4Q8BH32 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Susd4Q8BH32 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Susd4Q8BH32 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Susd4Q8BH32 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Susd4Q8BH32 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Susd4Q8BH32 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Susd4Q8BH32 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Susd4Q8BH32 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Susd4Q8BH32 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Susd4Q8BH32 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Susd4Q8BH32 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Susd4Q8BH32 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Susd4Q8BH32 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Susd4Q8BH32 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Susd4Q8BH32 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Susd4Q8BH32 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms