Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnpo1Q8BFY9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnpo1Q8BFY9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnpo1Q8BFY9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnpo1Q8BFY9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnpo1Q8BFY9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnpo1Q8BFY9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnpo1Q8BFY9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnpo1Q8BFY9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnpo1Q8BFY9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnpo1Q8BFY9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnpo1Q8BFY9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnpo1Q8BFY9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnpo1Q8BFY9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnpo1Q8BFY9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnpo1Q8BFY9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnpo1Q8BFY9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnpo1Q8BFY9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnpo1Q8BFY9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnpo1Q8BFY9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnpo1Q8BFY9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnpo1Q8BFY9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnpo1Q8BFY9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnpo1Q8BFY9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnpo1Q8BFY9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnpo1Q8BFY9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnpo1Q8BFY9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnpo1Q8BFY9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnpo1Q8BFY9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnpo1Q8BFY9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms