Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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H2-M10.4Q85ZW8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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H2-M10.4Q85ZW8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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H2-M10.4Q85ZW8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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H2-M10.4Q85ZW8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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H2-M10.4Q85ZW8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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H2-M10.4Q85ZW8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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