Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Ttc28Q80XJ3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms