Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrrc1Q80VQ1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrrc1Q80VQ1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrrc1Q80VQ1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrrc1Q80VQ1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrrc1Q80VQ1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrrc1Q80VQ1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrrc1Q80VQ1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrrc1Q80VQ1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lrrc1Q80VQ1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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