Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc155Q80VJ8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms