Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

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Length 627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek5Q7TSC3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek5Q7TSC3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms