Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec4b1Q7TS58 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4b1Q7TS58 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms