Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prrc2bQ7TPM1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms