Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms