Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ06

Cep162, Centrosomal protein of 162 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep162Q6ZQ06 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cep162Q6ZQ06 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cep162Q6ZQ06 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cep162Q6ZQ06 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cep162Q6ZQ06 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cep162Q6ZQ06 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Cep162Q6ZQ06 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cep162Q6ZQ06 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cep162Q6ZQ06 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms