Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms