Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bnip1Q6QD59 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bnip1Q6QD59 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bnip1Q6QD59 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bnip1Q6QD59 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bnip1Q6QD59 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bnip1Q6QD59 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bnip1Q6QD59 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bnip1Q6QD59 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bnip1Q6QD59 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bnip1Q6QD59 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bnip1Q6QD59 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bnip1Q6QD59 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bnip1Q6QD59 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bnip1Q6QD59 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bnip1Q6QD59 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bnip1Q6QD59 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bnip1Q6QD59 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bnip1Q6QD59 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bnip1Q6QD59 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bnip1Q6QD59 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bnip1Q6QD59 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bnip1Q6QD59 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bnip1Q6QD59 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bnip1Q6QD59 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bnip1Q6QD59 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bnip1Q6QD59 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Bnip1Q6QD59 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Bnip1Q6QD59 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms