Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nup98Q6PFD9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms