Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE3

Rrm2b, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm2bQ6PEE3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrm2bQ6PEE3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrm2bQ6PEE3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrm2bQ6PEE3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrm2bQ6PEE3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrm2bQ6PEE3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrm2bQ6PEE3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrm2bQ6PEE3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrm2bQ6PEE3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrm2bQ6PEE3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrm2bQ6PEE3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrm2bQ6PEE3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrm2bQ6PEE3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrm2bQ6PEE3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrm2bQ6PEE3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrm2bQ6PEE3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms