Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slx4Q6P1D7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms