Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms