Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CltcQ68FD5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CltcQ68FD5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CltcQ68FD5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CltcQ68FD5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CltcQ68FD5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CltcQ68FD5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CltcQ68FD5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CltcQ68FD5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CltcQ68FD5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CltcQ68FD5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CltcQ68FD5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CltcQ68FD5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CltcQ68FD5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CltcQ68FD5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CltcQ68FD5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CltcQ68FD5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CltcQ68FD5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CltcQ68FD5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CltcQ68FD5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CltcQ68FD5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CltcQ68FD5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CltcQ68FD5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CltcQ68FD5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CltcQ68FD5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CltcQ68FD5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CltcQ68FD5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CltcQ68FD5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CltcQ68FD5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CltcQ68FD5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CltcQ68FD5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CltcQ68FD5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms