Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrhQ62361 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TrhQ62361 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TrhQ62361 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrhQ62361 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrhQ62361 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrhQ62361 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TrhQ62361 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TrhQ62361 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TrhQ62361 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TrhQ62361 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TrhQ62361 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TrhQ62361 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TrhQ62361 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TrhQ62361 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TrhQ62361 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TrhQ62361 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TrhQ62361 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms