Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SypQ62277 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SypQ62277 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SypQ62277 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SypQ62277 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SypQ62277 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SypQ62277 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SypQ62277 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SypQ62277 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SypQ62277 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SypQ62277 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SypQ62277 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SypQ62277 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SypQ62277 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SypQ62277 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SypQ62277 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SypQ62277 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SypQ62277 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SypQ62277 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SypQ62277 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SypQ62277 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SypQ62277 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SypQ62277 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SypQ62277 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SypQ62277 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SypQ62277 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SypQ62277 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SypQ62277 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SypQ62277 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SypQ62277 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SypQ62277 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SypQ62277 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SypQ62277 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SypQ62277 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SypQ62277 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SypQ62277 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SypQ62277 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SypQ62277 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SypQ62277 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SypQ62277 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SypQ62277 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SypQ62277 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SypQ62277 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SypQ62277 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SypQ62277 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SypQ62277 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SypQ62277 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SypQ62277 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SypQ62277 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SypQ62277 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SypQ62277 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SypQ62277 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SypQ62277 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SypQ62277 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SypQ62277 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SypQ62277 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SypQ62277 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SypQ62277 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SypQ62277 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SypQ62277 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SypQ62277 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SypQ62277 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SypQ62277 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SypQ62277 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SypQ62277 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SypQ62277 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SypQ62277 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SypQ62277 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SypQ62277 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SypQ62277 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SypQ62277 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SypQ62277 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SypQ62277 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SypQ62277 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SypQ62277 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SypQ62277 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SypQ62277 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SypQ62277 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SypQ62277 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SypQ62277 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SypQ62277 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SypQ62277 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SypQ62277 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SypQ62277 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SypQ62277 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SypQ62277 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SypQ62277 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SypQ62277 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SypQ62277 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SypQ62277 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SypQ62277 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SypQ62277 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SypQ62277 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SypQ62277 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SypQ62277 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SypQ62277 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SypQ62277 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SypQ62277 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SypQ62277 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SypQ62277 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms