Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms