Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gli3Q61602 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms