Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AcanQ61282 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AcanQ61282 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
AcanQ61282 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
AcanQ61282 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AcanQ61282 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AcanQ61282 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AcanQ61282 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AcanQ61282 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AcanQ61282 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AcanQ61282 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AcanQ61282 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AcanQ61282 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AcanQ61282 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AcanQ61282 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AcanQ61282 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AcanQ61282 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AcanQ61282 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AcanQ61282 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AcanQ61282 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AcanQ61282 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AcanQ61282 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AcanQ61282 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AcanQ61282 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AcanQ61282 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AcanQ61282 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AcanQ61282 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
AcanQ61282 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AcanQ61282 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AcanQ61282 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AcanQ61282 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms