Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TmpoQ61033 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TmpoQ61033 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms