Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms