Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms