Protein–RNA interactions for Protein: Q60778

Nfkbib, NF-kappa-B inhibitor beta, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbibQ60778 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms