Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms