Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms