Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFZ0

UPF0711 protein C18orf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5XFZ0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q5XFZ0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q5XFZ0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q5XFZ0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q5XFZ0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q5XFZ0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q5XFZ0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q5XFZ0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q5XFZ0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q5XFZ0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q5XFZ0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q5XFZ0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q5XFZ0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q5XFZ0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Q5XFZ0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q5XFZ0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Q5XFZ0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q5XFZ0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q5XFZ0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q5XFZ0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q5XFZ0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q5XFZ0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q5XFZ0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q5XFZ0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q5XFZ0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q5XFZ0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q5XFZ0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q5XFZ0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Q5XFZ0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms