Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brip1Q5SXJ3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms