Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX39

Myh4, Myosin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,939 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh4Q5SX39 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myh4Q5SX39 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myh4Q5SX39 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myh4Q5SX39 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myh4Q5SX39 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myh4Q5SX39 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myh4Q5SX39 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myh4Q5SX39 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myh4Q5SX39 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myh4Q5SX39 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myh4Q5SX39 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myh4Q5SX39 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myh4Q5SX39 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myh4Q5SX39 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myh4Q5SX39 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myh4Q5SX39 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myh4Q5SX39 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myh4Q5SX39 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myh4Q5SX39 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myh4Q5SX39 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myh4Q5SX39 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myh4Q5SX39 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myh4Q5SX39 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myh4Q5SX39 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myh4Q5SX39 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myh4Q5SX39 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Myh4Q5SX39 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Myh4Q5SX39 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Myh4Q5SX39 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Myh4Q5SX39 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Myh4Q5SX39 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myh4Q5SX39 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Myh4Q5SX39 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Myh4Q5SX39 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Myh4Q5SX39 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myh4Q5SX39 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myh4Q5SX39 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myh4Q5SX39 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myh4Q5SX39 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myh4Q5SX39 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myh4Q5SX39 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myh4Q5SX39 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms