Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Med13Q5SWW4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms