Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVR0

Tbc1d9b, TBC1 domain family member 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d9bQ5SVR0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbc1d9bQ5SVR0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tbc1d9bQ5SVR0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms