Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc85aQ5SP85 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc85aQ5SP85 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc85aQ5SP85 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc85aQ5SP85 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc85aQ5SP85 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc85aQ5SP85 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc85aQ5SP85 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc85aQ5SP85 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc85aQ5SP85 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc85aQ5SP85 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc85aQ5SP85 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc85aQ5SP85 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc85aQ5SP85 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc85aQ5SP85 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc85aQ5SP85 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc85aQ5SP85 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc85aQ5SP85 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc85aQ5SP85 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc85aQ5SP85 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc85aQ5SP85 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc85aQ5SP85 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc85aQ5SP85 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc85aQ5SP85 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc85aQ5SP85 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc85aQ5SP85 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc85aQ5SP85 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc85aQ5SP85 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc85aQ5SP85 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms