Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpm3Q5F4S9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms