Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp22Q5DU02 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms