Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ndufaf2Q59J78 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ndufaf2Q59J78 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms