Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Otol1Q4ZJM7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otol1Q4ZJM7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otol1Q4ZJM7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otol1Q4ZJM7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otol1Q4ZJM7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otol1Q4ZJM7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otol1Q4ZJM7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otol1Q4ZJM7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otol1Q4ZJM7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otol1Q4ZJM7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otol1Q4ZJM7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Otol1Q4ZJM7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otol1Q4ZJM7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms