Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0F0

Rimbp3, RIMS-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rimbp3Q3V0F0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rimbp3Q3V0F0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rimbp3Q3V0F0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rimbp3Q3V0F0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms